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人类代谢组数据库 (HMDB) 是一个全面、免费的资源，包含有关人体内发现的小分子代谢物的详细信息。
Histolab 是一个用于处理数字病理学中的整个幻灯片图像 (WSI) 的 Python 库。它可以自动执行组织检测，从十亿像素图像中提取信息图块，并为深度学习管道准备数据集。该库可处理多种 WSI 格式，实现复杂的组织分割，并提供灵活的切片提取策略。
GWAS 目录是由国家人类基因组研究所 (NHGRI) 和欧洲生物信息学研究所 (EBI) 维护的已发表的全基因组关联研究的综合存储库。该目录包含来自数千份 GWAS 出版物的精选 SNP 性状关联，包括遗传变异、相关性状和疾病、p 值、效应大小以及许多研究的完整摘要统计数据。
Gtars 是一个高性能 Rust 工具包，用于操作、分析和处理基因组区间数据。它提供了用于重叠检测、覆盖分析、机器学习标记化和参考序列管理的专用工具。
gget 是一个命令行生物信息学工具和 Python 包，提供对 20 多个基因组数据库和分析方法的统一访问。通过一致的界面查询基因信息、序列分析、蛋白质结构、表达数据和疾病关联。所有 gget 模块都可以用作命令行工具和 Python 函数。
检测可用的计算资源并为科学计算任务生成战略建议。该技能可自动识别 CPU 功能、GPU 可用性（NVIDIA CUDA、AMD ROCm、Apple Silicon Metal）、内存限制和磁盘空间，以帮助做出有关计算方法的明智决策。
Gene Expression Omnibus (GEO) 是 NCBI 的高通量基因表达和功能基因组学数据的公共存储库。 GEO 包含超过 264,000 项研究，其中来自基于阵列和基于序列的实验的超过 800 万个样本。
Geniml 是一个 Python 包，用于根据 BED 文件的基因组间隔数据构建机器学习模型。它提供了用于学习基因组区域、单细胞和元数据标签嵌入的无监督方法，从而实现相似性搜索、聚类和下游 ML 任务。
NCBI Gene 是一个整合了不同物种基因信息的综合数据库。它提供命名法、参考序列 (RefSeqs)、染色体图谱、生物途径、遗传变异、表型以及全球基因组资源的交叉引用。
FlowIO 是一个轻量级 Python 库，用于读写流式细胞术标准 (FCS) 文件。解析 FCS 元数据、提取事件数据并创建具有最小依赖性的新 FCS 文件。该库支持 FCS 版本 2.0、3.0 和 3.1，使其成为后端服务、数据管道和基本细胞计数文件操作的理想选择。
通过 openFDA 访问全面的 FDA 监管数据，openFDA 是 FDA 为公共数据集提供开放 API 的举措。使用具有标准化接口的Python查询有关药品、医疗器械、食品、动物/兽医产品和物质的信息。
对跨多个领域的科学数据文件执行全面的探索性数据分析 (EDA)。该技能提供自动文件类型检测、特定格式分析、数据质量评估，并生成适合文档和下游分析规划的详细降价报告。
ETE（树探索环境）是一个用于系统发育和层次树分析的工具包。操纵树木、分析进化事件、可视化结果并与生物数据库集成以进行系统发育研究和聚类分析。
ESM 提供最先进的蛋白质语言模型，用于理解、生成和设计蛋白质。该技能支持使用两个模型系列：用于跨序列、结构和功能的生成蛋白质设计的 ESM3，以及用于高效蛋白质表示学习和嵌入的 ESM C。
访问和查询 Ensembl 基因组数据库，这是由 EMBL-EBI 维护的脊椎动物基因组数据的综合资源。该数据库提供 250 多个物种的基因注释、序列、变异、监管信息和比较基因组学数据。当前版本为 115（2025 年 9 月）。
欧洲核苷酸档案库 (ENA) 是核苷酸序列数据和相关元数据的综合公共存储库。通过基因组学和生物信息学管道的 REST API 和 FTP 访问和查询 DNA/RNA 序列、原始读数、基因组组装和功能注释。
DrugBank 是一个综合性生物信息学和化学信息学数据库，包含药物和药物靶点的详细信息。该技能支持以编程方式访问 DrugBank 数据，包括约 9,591 个药物条目（2,037 个 FDA 批准的小分子、241 种生物技术药物、96 种营养保健品和 6,000 多种实验化合物），每个条目有 200 多个数据字段。
.docx 文件是包含 XML 文件和资源的 ZIP 存档。使用文本提取、原始 XML 访问或红线工作流程创建、编辑或分析 Word 文档。将此技能应用于专业文档处理、跟踪更改和内容操作。
DNAnexus 是一个用于生物医学数据分析和基因组学的云平台。构建和部署应用程序/小程序、管理数据对象、运行工作流程以及使用 dxpy Python SDK 进行基因组学管道开发和执行。
DiffDock 是一种基于扩散的深度学习工具，用于分子对接，可预测小分子配体与蛋白质靶标的 3D 结合姿势。它代表了计算对接的最先进水平，对于基于结构的药物发现和化学生物学至关重要。
